Банки данных Swiss-Prot и UniProt


на главную

Данные банка Swiss-Prot о белке HMP_Ecoli

 Метка поля (line code) 
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документаACP24232
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности)IDHMP_ECOLI
Название белка, отражающее его функцииDEФлавогемопротеин. Flavohemoprotein (Hemoglobin-like protein) (Flavohemoglobin) (HMP) (Nitric oxide dioxygenase) (EC 1.14.12.17) (NO oxygenase) (NOD)
Дата создания документаDT01-MAR-1992
Дата последнего исправления аннотацииDT01-FEB-2005
Название организмаOSEscherichia coli
Полное название таксонаOCBacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательностиSQ396 а.о.
Молекулярная масса белкаSQ43868 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документаRN36
Название журнала с самой свежей публикациейRLFEMS Microbiol. Rev. 27:525-545(2003)
Описание вторичной структурыFTЕсть последовательное описание элементов вторичной структуры. Указаны начальный и конечный аминокислотные остатки этого элемента
Что содержит поле комментариев?CC
  1. Описание функции
  2. Каталитическая активность (химическая реакция, осуществляемая ферментом)
  3. Кофакторы
  4. Биофизикохимические свойства
  5. Количество субъединиц
  6. Внутриклеточная локализация
  7. Фактор индукции
  8. Принадлежность к определенному семейству
Какие особенности последовательности указаны?FT
  1. Обозначены домены
  2. Выделены аминокислоты активного центра
  3. Связанный с белком атом металла (Fe)
  4. Связанные с белком лиганды
  5. Зарегистрированные мутации
Идентификатор файла PDBDR1GVH

ресурс swissprot

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка HMP_Ecoli

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS (Sequence Retrieval System)
ТаксонЗапросКоличество найденных документов
Археи (Archaea)((((([uniprot-Description:Flavohemoprotein] | [uniprot-Description:Hemoglobin-like protein*]) | [uniprot-Description:Flavohemoglobin]) | [uniprot-Description:NOD]) | [uniprot-Description:1.14.12.17]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea])0
Бактерии (Bacteria)((((([uniprot-Description:Flavohemoprotein] | [uniprot-Description:Hemoglobin-like protein*]) | [uniprot-Description:Flavohemoglobin]) | [uniprot-Description:NOD]) | [uniprot-Description:1.14.12.17]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria])79
Эукариоты (Eukaryota)((((([uniprot-Description:Flavohemoprotein] | [uniprot-Description:Hemoglobin-like protein*]) | [uniprot-Description:Flavohemoglobin]) | [uniprot-Description:NOD]) | [uniprot-Description:1.14.12.17]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota])12



© Тихонов Максим, 2005